Kalurahan Wahyuharjo masuk dalam wilayah Kabupaten Kulon Progo dibagian selatan tepatnya di Kapanewon Lendah. Sebelum tahun 2020 penyebutan Kalurahan Wahyuharjo sendiri menggunakan nomenklatur 'desa'. Namun dengan adanya Peraturan Daerah Kabupaten Kulon Progo Nomor 4 Tahun 2019 tentang Penetapan Kalurahan; seluruh desa-desa di Kabupaten Kulon Progo berubah nomenklaturnya menggunakan kalurahan seiring berubahnya nomenklatur penyebutan kecamatan menjadi kapanewon. Perubahan tersebut merupakan salah satu amanat Undang-Undang Nomor 13 Tahun 2012 tentang Keistimewaan Daerah Istimewa Yogyakarta dalam hal pengaturan kelembagaan.