Kalurahan Wahyuharjo terbagi menjadi 5 Padukuhan dengan tiap-tiap padukuhan memiliki 2 RW dan 4 RT sehingga dalam satu kalurahan terdapat 10 RW, dan 20 RT yang masing-masing RT/RW dipimpin oleh ketua RT/RW berdasarkan hasil musyawarah masyarakat setempat. RT sendiri merupakan lembaga kemasyarakatan yang dibentuk Pemerintah Kalurahan sebagai bagian wilayah administrasi kalurahan untuk memelihara dan melestarikan nilainilai kehidupan yang berdasarkan kegotongroyongan kekeluargaan, membantu meningkatkan kelancaran tugas pemerintah, pembangunan dan kemasyarakatan di Kalurahan serta meningkatkan peran serta masyarakat dalam pembangunan. Sedangkan RW merupakan lembaga kemasyarakatan yang dibentuk Pemerintah Kalurahan sebagai bagian wilayah administrasi kalurahan yang terdiri dari beberapa RT dalam rangka mengoordinasikan kegiatan RT. Padukuhan merupakan bagian wilayah dalam Kalurahan yang merupakan lingkungan kerja Lurah dan dipimpin seorang Dukuh, sehingga dalam pelaksanaan pembangunan lingkup wilayah padukuhan dilakukan oleh Dukuh sebagai pelaksananya. Pembagian wilayah di Kalurahan Wahyuharjo adalah sebagai berikut:

• Padukuhan Bulu : 4 RT dan 2 RW
• Padukuhan Maesan Wetan : 4 RT dan 2 RW
• Padukuhan Maesan Kulon : 4 RT dan 2 RW
• Padukuhan Sungapan Kidul : 4 RT dan 2 RW
• Padukuhan Sungapan Lor : 4 RT dan 2 RW

A. Batas Wilayah Desa

Letak geografi Desa  Wahyuharjo , terletak diantara :

Sebelah Utara                                  : Desa Bumirejo dan Desa Krembangan

Sebelah selatan                               : Desa Tirtorahayu

Sebelah Barat                                  : Desa Tirtorahayu

Sebelah Timur                                 : Desa Bumirejo

B. Luas Wilayah Desa

1. Pemukiman : 26,46 ha
2. Pertanian Sawah : 101,84 ha
3. Ladang/tegalan : 13 ha
4. Perkantoran : 0,5 ha
5. Sekolah : 1 ha
6. Jalan : 5 ha
7. Lapangan sepak bola : 2 ha

• Luas Tanah Kas Kalurahan 240.434 m2 dengan perincian penggunaan sebagai berikut :

C. Orbitasi

1. Terletak di ketinggian 7m DPL
2. Jarak ke ibu kota kecamatan :  7  Km
3. Lama jarak tempuh ke ibu kota kecamatan :  15 Menit
4. Jarak ke ibu kota kabupetan : 12 Km
5. Lama jarak tempuh ke ibu kota Kabupaten :  25 Menit